Niedokrwienie wywołuje także uwalnianie z błony komórkowej produktów lipidowych, takich jak kwas arachidonowy oraz czynnik aktywujący płytki (PAF), oraz prowadzi do gromadzenia różnych substancji osmolarnych: jonów sodowych, kwasu mlekowego i innych kwasów organicznych, które ułatwiają tworzenie się obrzęku po recyrkulacji. Stąd też rozwój obrzęku mózgu początkowo i przeważająco występuje na obrzeżu ogniska zawałowego.